MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Calothrix sp. PCC 7507 chromosome

Total Repeats: 27662

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019682	GCA	2	6	20	25	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_019682	GGT	2	6	28	33	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019682	AGC	2	6	1431	1436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_019682	TA	3	6	1442	1447	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019682	TCA	2	6	1639	1644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_019682	GTG	2	6	1670	1675	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_019682	GGTAGA	2	12	1698	1709	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_019682	TAAT	2	8	1737	1744	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_019682	AAT	2	6	3049	3054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_019682	AAT	2	6	3060	3065	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_019682	CTC	2	6	3117	3122	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_019682	CAA	2	6	3170	3175	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_019682	A	6	6	3182	3187	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019682	AGC	2	6	3242	3247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_019682	TAT	2	6	3258	3263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_019682	AACT	2	8	3284	3291	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_019682	ACCTA	2	10	5451	5460	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
18	NC_019682	GAT	2	6	5603	5608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019682	CTCA	2	8	5683	5690	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_019682	CT	3	6	5708	5713	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_019682	ACAT	2	8	7386	7393	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_019682	ACCCC	2	10	7397	7406	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
23	NC_019682	CA	3	6	7447	7452	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_019682	AC	3	6	7482	7487	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_019682	TTCGTT	2	12	7510	7521	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_019682	TG	3	6	7679	7684	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_019682	AGGGG	2	10	7703	7712	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019682	TTAA	2	8	7739	7746	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_019682	CA	3	6	7818	7823	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_019682	ATT	2	6	7839	7844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019682	T	6	6	7843	7848	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019682	TAC	2	6	7876	7881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_019682	A	6	6	7885	7890	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_019682	TAA	2	6	8115	8120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_019682	TAA	3	9	8124	8132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_019682	CT	3	6	8146	8151	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_019682	ATC	2	6	9160	9165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_019682	AGC	2	6	11286	11291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_019682	ATC	2	6	11418	11423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_019682	AGG	2	6	11438	11443	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_019682	TAGA	2	8	12215	12222	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_019682	CTA	2	6	13512	13517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_019682	GTA	2	6	13617	13622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_019682	ATC	2	6	13909	13914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_019682	GGC	2	6	15456	15461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_019682	GACT	2	8	15464	15471	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_019682	TGG	2	6	15592	15597	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_019682	T	6	6	15625	15630	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_019682	CAA	2	6	15631	15636	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_019682	TTTA	2	8	16234	16241	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_019682	GTT	2	6	16256	16261	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_019682	CCA	2	6	16302	16307	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_019682	AT	3	6	19568	19573	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_019682	GTA	2	6	19604	19609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_019682	ACT	2	6	19655	19660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_019682	CACCC	2	10	19683	19692	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
57	NC_019682	GCAA	2	8	19717	19724	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
58	NC_019682	TGA	3	9	19735	19743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_019682	TCT	2	6	19819	19824	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_019682	TAC	2	6	19828	19833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_019682	ATTT	2	8	19895	19902	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_019682	A	7	7	19909	19915	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_019682	TAA	2	6	19941	19946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_019682	TGC	2	6	19974	19979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_019682	CTT	2	6	19983	19988	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_019682	CAAT	2	8	20029	20036	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_019682	A	6	6	20067	20072	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_019682	ATA	2	6	20140	20145	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_019682	TGTT	2	8	20197	20204	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_019682	CTA	2	6	20212	20217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_019682	A	8	8	20240	20247	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_019682	TA	3	6	20270	20275	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_019682	A	6	6	20327	20332	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_019682	AGT	2	6	22683	22688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_019682	GTCT	2	8	22693	22700	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_019682	AC	3	6	22824	22829	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_019682	TAT	2	6	22897	22902	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_019682	T	6	6	23029	23034	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_019682	AGAT	2	8	23115	23122	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_019682	A	6	6	23177	23182	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_019682	TA	3	6	23231	23236	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_019682	GGA	2	6	23314	23319	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_019682	TCA	2	6	23701	23706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_019682	T	6	6	23746	23751	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_019682	AG	3	6	23802	23807	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_019682	TTA	2	6	23967	23972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_019682	GTA	2	6	24005	24010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_019682	CA	3	6	24036	24041	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_019682	TGA	2	6	24061	24066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_019682	ATTA	2	8	24080	24087	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_019682	AG	3	6	25347	25352	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_019682	GGA	2	6	25393	25398	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_019682	GAT	2	6	26209	26214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_019682	ATTA	2	8	28421	28428	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_019682	TCC	2	6	28464	28469	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_019682	ATG	2	6	29991	29996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_019682	T	6	6	30009	30014	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_019682	TGC	2	6	30199	30204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_019682	ACA	2	6	30222	30227	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_019682	A	7	7	31257	31263	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_019682	AGA	2	6	31298	31303	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_019682	ATT	2	6	32285	32290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_019682	TAA	2	6	32294	32299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_019682	TCT	2	6	33529	33534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_019682	TAA	2	6	33543	33548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_019682	TTTA	2	8	33565	33572	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_019682	T	7	7	33598	33604	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_019682	TAT	2	6	33622	33627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_019682	TCAAT	2	10	33702	33711	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
110	NC_019682	TA	3	6	33753	33758	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_019682	T	6	6	33773	33778	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_019682	TCG	2	6	33802	33807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_019682	AGC	2	6	33829	33834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_019682	AGT	2	6	33887	33892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_019682	GAT	2	6	33905	33910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_019682	A	6	6	33936	33941	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_019682	ATA	2	6	33998	34003	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_019682	TA	3	6	34020	34025	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_019682	CT	3	6	35774	35779	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_019682	TTA	2	6	35976	35981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_019682	T	6	6	36050	36055	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_019682	GA	3	6	37509	37514	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_019682	A	6	6	37527	37532	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_019682	TTA	2	6	37533	37538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_019682	CAC	2	6	37886	37891	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_019682	AATC	2	8	37916	37923	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_019682	T	7	7	37943	37949	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_019682	ACA	2	6	37968	37973	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_019682	GCGT	2	8	38585	38592	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
130	NC_019682	GGA	2	6	38646	38651	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_019682	CTGG	2	8	38694	38701	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
132	NC_019682	T	6	6	38909	38914	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_019682	TTA	2	6	38953	38958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_019682	TAG	2	6	39070	39075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_019682	A	7	7	39102	39108	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_019682	A	7	7	39857	39863	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_019682	C	8	8	39874	39881	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
138	NC_019682	TCAA	2	8	39886	39893	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_019682	CAAAT	2	10	40853	40862	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
140	NC_019682	T	7	7	40894	40900	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_019682	TAAT	2	8	40906	40913	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_019682	ATT	2	6	40962	40967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_019682	T	7	7	42056	42062	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_019682	TAA	2	6	42077	42082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_019682	ACACC	3	15	43646	43660	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
146	NC_019682	GTT	2	6	43769	43774	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
147	NC_019682	TTG	2	6	43791	43796	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
148	NC_019682	CGC	2	6	43847	43852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
149	NC_019682	GAAA	2	8	43858	43865	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
150	NC_019682	ATG	2	6	43929	43934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
151	NC_019682	ACT	2	6	43937	43942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_019682	T	8	8	44674	44681	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_019682	GTT	2	6	45837	45842	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
154	NC_019682	T	6	6	46938	46943	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_019682	GCATCT	2	12	46945	46956	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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159	NC_019682	TAA	2	6	49831	49836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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164	NC_019682	T	6	6	53966	53971	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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172	NC_019682	TGT	2	6	57446	57451	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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175	NC_019682	GCA	2	6	57507	57512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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179	NC_019682	AAG	2	6	57647	57652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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182	NC_019682	GAGC	2	8	58490	58497	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
183	NC_019682	ATTT	2	8	59170	59177	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
184	NC_019682	TCT	2	6	59179	59184	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
185	NC_019682	CCTT	2	8	59196	59203	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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187	NC_019682	ATT	2	6	60839	60844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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195	NC_019682	TCTTA	2	10	62898	62907	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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287	NC_019682	GCA	2	6	74845	74850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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420	NC_019682	GTT	2	6	97939	97944	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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433	NC_019682	GT	3	6	99324	99329	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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441	NC_019682	ATA	2	6	101793	101798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
442	NC_019682	ATA	2	6	102117	102122	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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483	NC_019682	A	6	6	116066	116071	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
484	NC_019682	A	6	6	116316	116321	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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